Акционерное общество «Венчурная компания «Якутия» было создано 5 октября 2011 года в соответствии с распоряжением Правительства Республики Саха (Якутия) «Об участии Республики Саха (Якутия) в создании ОАО «Венчурная компания «Якутия» № 1044-р «Об участии Республики Саха (Якутия) в создании ОАО «Венчурная компания «Якутия».
На данный момент компания является единственным на Дальневосточном федеральном округе фондом прямых и венчурных инвестиций с государственным участием, ведущим активную инвестиционную деятельность.